Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWV3

RTN4IP1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4IP1Q8WWV3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4IP1Q8WWV3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4IP1Q8WWV3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4IP1Q8WWV3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTN4IP1Q8WWV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN4IP1Q8WWV3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms