Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP27Q8WVK2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP27Q8WVK2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP27Q8WVK2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP27Q8WVK2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRNP27Q8WVK2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP27Q8WVK2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP27Q8WVK2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP27Q8WVK2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP27Q8WVK2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNRNP27Q8WVK2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRNP27Q8WVK2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRNP27Q8WVK2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP27Q8WVK2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNRNP27Q8WVK2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP27Q8WVK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms