Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACVR1CQ8NER5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACVR1CQ8NER5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ACVR1CQ8NER5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACVR1CQ8NER5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACVR1CQ8NER5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACVR1CQ8NER5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACVR1CQ8NER5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms