Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE62

CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHDHQ8NE62 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHDHQ8NE62 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHDHQ8NE62 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHDHQ8NE62 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHDHQ8NE62 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHDHQ8NE62 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHDHQ8NE62 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHDHQ8NE62 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHDHQ8NE62 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHDHQ8NE62 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHDHQ8NE62 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHDHQ8NE62 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHDHQ8NE62 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHDHQ8NE62 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms