Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A0

KRT222, Keratin-like protein KRT222, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT222Q8N1A0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT222Q8N1A0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT222Q8N1A0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT222Q8N1A0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT222Q8N1A0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT222Q8N1A0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT222Q8N1A0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT222Q8N1A0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT222Q8N1A0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT222Q8N1A0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT222Q8N1A0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT222Q8N1A0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT222Q8N1A0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT222Q8N1A0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT222Q8N1A0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT222Q8N1A0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT222Q8N1A0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT222Q8N1A0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT222Q8N1A0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT222Q8N1A0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT222Q8N1A0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT222Q8N1A0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT222Q8N1A0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT222Q8N1A0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT222Q8N1A0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KRT222Q8N1A0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT222Q8N1A0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms