Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLGN4XQ8N0W4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLGN4XQ8N0W4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NLGN4XQ8N0W4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLGN4XQ8N0W4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN4XQ8N0W4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLGN4XQ8N0W4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLGN4XQ8N0W4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms