Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms