Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV48

ERI1, 3'-5' exoribonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI1Q8IV48 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERI1Q8IV48 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERI1Q8IV48 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERI1Q8IV48 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERI1Q8IV48 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERI1Q8IV48 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERI1Q8IV48 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERI1Q8IV48 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI1Q8IV48 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI1Q8IV48 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI1Q8IV48 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERI1Q8IV48 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERI1Q8IV48 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERI1Q8IV48 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms