Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CMC1Q7Z7K0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CMC1Q7Z7K0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CMC1Q7Z7K0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CMC1Q7Z7K0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CMC1Q7Z7K0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CMC1Q7Z7K0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CMC1Q7Z7K0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CMC1Q7Z7K0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CMC1Q7Z7K0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CMC1Q7Z7K0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CMC1Q7Z7K0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CMC1Q7Z7K0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CMC1Q7Z7K0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CMC1Q7Z7K0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CMC1Q7Z7K0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CMC1Q7Z7K0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CMC1Q7Z7K0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CMC1Q7Z7K0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CMC1Q7Z7K0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CMC1Q7Z7K0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CMC1Q7Z7K0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CMC1Q7Z7K0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CMC1Q7Z7K0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CMC1Q7Z7K0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CMC1Q7Z7K0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CMC1Q7Z7K0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMC1Q7Z7K0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CMC1Q7Z7K0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMC1Q7Z7K0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMC1Q7Z7K0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CMC1Q7Z7K0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMC1Q7Z7K0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CMC1Q7Z7K0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CMC1Q7Z7K0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CMC1Q7Z7K0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CMC1Q7Z7K0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CMC1Q7Z7K0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CMC1Q7Z7K0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CMC1Q7Z7K0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms