Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00173Q6ZV60 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00173Q6ZV60 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00173Q6ZV60 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00173Q6ZV60 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms