Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC73Q6ZRK6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC73Q6ZRK6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC73Q6ZRK6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC73Q6ZRK6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC73Q6ZRK6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC73Q6ZRK6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC73Q6ZRK6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC73Q6ZRK6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC73Q6ZRK6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC73Q6ZRK6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC73Q6ZRK6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC73Q6ZRK6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC73Q6ZRK6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC73Q6ZRK6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC73Q6ZRK6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC73Q6ZRK6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC73Q6ZRK6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC73Q6ZRK6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC73Q6ZRK6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC73Q6ZRK6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC73Q6ZRK6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC73Q6ZRK6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC73Q6ZRK6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC73Q6ZRK6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC73Q6ZRK6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC73Q6ZRK6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC73Q6ZRK6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC73Q6ZRK6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC73Q6ZRK6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC73Q6ZRK6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms