Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TREML4Q6UXN2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREML4Q6UXN2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREML4Q6UXN2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML4Q6UXN2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREML4Q6UXN2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREML4Q6UXN2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms