Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC83

C22orf42, Uncharacterized protein C22orf42, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf42Q6IC83 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf42Q6IC83 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf42Q6IC83 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf42Q6IC83 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C22orf42Q6IC83 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C22orf42Q6IC83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C22orf42Q6IC83 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C22orf42Q6IC83 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C22orf42Q6IC83 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C22orf42Q6IC83 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C22orf42Q6IC83 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms