Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC45A4Q5BKX6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC45A4Q5BKX6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC45A4Q5BKX6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC45A4Q5BKX6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC45A4Q5BKX6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC45A4Q5BKX6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC45A4Q5BKX6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC45A4Q5BKX6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC45A4Q5BKX6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC45A4Q5BKX6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC45A4Q5BKX6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC45A4Q5BKX6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms