Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIPR1Q53HC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIPR1Q53HC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIPR1Q53HC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EIPR1Q53HC9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIPR1Q53HC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms