Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP5B1Q2VPB7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP5B1Q2VPB7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP5B1Q2VPB7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP5B1Q2VPB7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP5B1Q2VPB7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP5B1Q2VPB7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP5B1Q2VPB7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP5B1Q2VPB7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP5B1Q2VPB7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP5B1Q2VPB7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP5B1Q2VPB7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP5B1Q2VPB7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms