Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR6A1Q15406 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR6A1Q15406 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR6A1Q15406 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NR6A1Q15406 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NR6A1Q15406 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR6A1Q15406 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms