Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR1Q15399 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR1Q15399 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TLR1Q15399 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TLR1Q15399 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLR1Q15399 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLR1Q15399 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms