Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAM2Q15035 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAM2Q15035 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAM2Q15035 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAM2Q15035 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAM2Q15035 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAM2Q15035 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAM2Q15035 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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