Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB39AQ14964 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB39AQ14964 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB39AQ14964 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB39AQ14964 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms