Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
COL9A3Q14050 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
COL9A3Q14050 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
COL9A3Q14050 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
COL9A3Q14050 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
COL9A3Q14050 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
COL9A3Q14050 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
COL9A3Q14050 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
COL9A3Q14050 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
COL9A3Q14050 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
COL9A3Q14050 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
COL9A3Q14050 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
COL9A3Q14050 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COL9A3Q14050 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
COL9A3Q14050 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
COL9A3Q14050 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
COL9A3Q14050 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
COL9A3Q14050 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
COL9A3Q14050 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
COL9A3Q14050 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
COL9A3Q14050 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
COL9A3Q14050 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
COL9A3Q14050 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
COL9A3Q14050 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
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