Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXM1Q08050 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXM1Q08050 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXM1Q08050 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOXM1Q08050 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXM1Q08050 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXM1Q08050 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXM1Q08050 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms