Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MDM2Q00987 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MDM2Q00987 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MDM2Q00987 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
MDM2Q00987 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MDM2Q00987 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MDM2Q00987 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MDM2Q00987 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MDM2Q00987 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MDM2Q00987 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
MDM2Q00987 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MDM2Q00987 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MDM2Q00987 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MDM2Q00987 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MDM2Q00987 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MDM2Q00987 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MDM2Q00987 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MDM2Q00987 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MDM2Q00987 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MDM2Q00987 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
MDM2Q00987 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MDM2Q00987 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MDM2Q00987 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MDM2Q00987 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MDM2Q00987 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MDM2Q00987 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MDM2Q00987 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MDM2Q00987 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MDM2Q00987 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MDM2Q00987 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MDM2Q00987 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MDM2Q00987 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MDM2Q00987 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MDM2Q00987 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MDM2Q00987 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MDM2Q00987 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MDM2Q00987 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MDM2Q00987 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MDM2Q00987 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MDM2Q00987 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MDM2Q00987 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
MDM2Q00987 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MDM2Q00987 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MDM2Q00987 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MDM2Q00987 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MDM2Q00987 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MDM2Q00987 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
MDM2Q00987 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MDM2Q00987 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms