Protein–RNA interactions for Protein: Q00887

PSG9, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 9, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG9Q00887 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG9Q00887 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG9Q00887 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG9Q00887 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG9Q00887 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms