Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP2P81877 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP2P81877 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP2P81877 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms