Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TPM4P67936 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TPM4P67936 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPM4P67936 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPM4P67936 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPM4P67936 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TPM4P67936 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TPM4P67936 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TPM4P67936 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TPM4P67936 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TPM4P67936 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TPM4P67936 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TPM4P67936 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TPM4P67936 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TPM4P67936 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TPM4P67936 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TPM4P67936 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TPM4P67936 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TPM4P67936 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM4P67936 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM4P67936 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM4P67936 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TPM4P67936 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPM4P67936 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPM4P67936 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPM4P67936 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPM4P67936 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPM4P67936 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TPM4P67936 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TPM4P67936 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPM4P67936 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TPM4P67936 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TPM4P67936 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TPM4P67936 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPM4P67936 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPM4P67936 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPM4P67936 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPM4P67936 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPM4P67936 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPM4P67936 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPM4P67936 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPM4P67936 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TPM4P67936 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TPM4P67936 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPM4P67936 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPM4P67936 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPM4P67936 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPM4P67936 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPM4P67936 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPM4P67936 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPM4P67936 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPM4P67936 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPM4P67936 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TPM4P67936 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPM4P67936 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPM4P67936 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPM4P67936 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPM4P67936 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM4P67936 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM4P67936 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM4P67936 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM4P67936 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPM4P67936 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TPM4P67936 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPM4P67936 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPM4P67936 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPM4P67936 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPM4P67936 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TPM4P67936 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TPM4P67936 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPM4P67936 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPM4P67936 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM4P67936 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM4P67936 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM4P67936 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM4P67936 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPM4P67936 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPM4P67936 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPM4P67936 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPM4P67936 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPM4P67936 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPM4P67936 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM4P67936 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM4P67936 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPM4P67936 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPM4P67936 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPM4P67936 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPM4P67936 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPM4P67936 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPM4P67936 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPM4P67936 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPM4P67936 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPM4P67936 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPM4P67936 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPM4P67936 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPM4P67936 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPM4P67936 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPM4P67936 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TPM4P67936 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPM4P67936 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms