Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HERV-K104P61576 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERV-K104P61576 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERV-K104P61576 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERV-K104P61576 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERV-K104P61576 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERV-K104P61576 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms