Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVPABLB-1P60509 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVPABLB-1P60509 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVPABLB-1P60509 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVPABLB-1P60509 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVPABLB-1P60509 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVPABLB-1P60509 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVPABLB-1P60509 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVPABLB-1P60509 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVPABLB-1P60509 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVPABLB-1P60509 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVPABLB-1P60509 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVPABLB-1P60509 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVPABLB-1P60509 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVPABLB-1P60509 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVPABLB-1P60509 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms