Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGFRP43088 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGFRP43088 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGFRP43088 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGFRP43088 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGFRP43088 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRP43088 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms