Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACAA2P42765 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACAA2P42765 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAA2P42765 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACAA2P42765 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACAA2P42765 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms