Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL3P39023 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL3P39023 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL3P39023 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL3P39023 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL3P39023 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL3P39023 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL3P39023 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL3P39023 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL3P39023 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL3P39023 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL3P39023 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL3P39023 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL3P39023 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL3P39023 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL3P39023 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL3P39023 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL3P39023 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL3P39023 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL3P39023 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL3P39023 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL3P39023 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL3P39023 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL3P39023 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL3P39023 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL3P39023 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL3P39023 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL3P39023 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL3P39023 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL3P39023 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL3P39023 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL3P39023 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL3P39023 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL3P39023 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL3P39023 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL3P39023 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL3P39023 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL3P39023 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL3P39023 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL3P39023 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL3P39023 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL3P39023 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL3P39023 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL3P39023 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL3P39023 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL3P39023 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL3P39023 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL3P39023 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL3P39023 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL3P39023 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL3P39023 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL3P39023 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL3P39023 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL3P39023 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL3P39023 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL3P39023 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL3P39023 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL3P39023 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL3P39023 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL3P39023 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL3P39023 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL3P39023 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL3P39023 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL3P39023 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL3P39023 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL3P39023 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL3P39023 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL3P39023 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL3P39023 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL3P39023 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL3P39023 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL3P39023 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL3P39023 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL3P39023 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL3P39023 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL3P39023 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL3P39023 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL3P39023 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL3P39023 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL3P39023 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL3P39023 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL3P39023 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL3P39023 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL3P39023 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL3P39023 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL3P39023 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL3P39023 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL3P39023 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL3P39023 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL3P39023 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPL3P39023 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPL3P39023 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPL3P39023 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL3P39023 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL3P39023 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL3P39023 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL3P39023 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL3P39023 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL3P39023 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL3P39023 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms