Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP6V1E1P36543 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP6V1E1P36543 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1E1P36543 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1E1P36543 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V1E1P36543 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms