Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC1P35052 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC1P35052 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPC1P35052 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPC1P35052 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC1P35052 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC1P35052 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC1P35052 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC1P35052 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC1P35052 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC1P35052 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC1P35052 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC1P35052 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC1P35052 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC1P35052 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC1P35052 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC1P35052 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC1P35052 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC1P35052 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC1P35052 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC1P35052 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GPC1P35052 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC1P35052 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC1P35052 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC1P35052 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC1P35052 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC1P35052 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC1P35052 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC1P35052 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC1P35052 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC1P35052 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC1P35052 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC1P35052 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC1P35052 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC1P35052 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC1P35052 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC1P35052 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC1P35052 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC1P35052 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC1P35052 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC1P35052 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC1P35052 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC1P35052 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC1P35052 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC1P35052 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC1P35052 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC1P35052 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC1P35052 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC1P35052 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC1P35052 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC1P35052 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC1P35052 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC1P35052 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC1P35052 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC1P35052 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC1P35052 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC1P35052 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC1P35052 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC1P35052 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC1P35052 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC1P35052 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC1P35052 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC1P35052 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC1P35052 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC1P35052 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC1P35052 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC1P35052 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC1P35052 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC1P35052 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC1P35052 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC1P35052 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC1P35052 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC1P35052 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC1P35052 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC1P35052 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC1P35052 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC1P35052 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC1P35052 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC1P35052 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC1P35052 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC1P35052 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC1P35052 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC1P35052 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC1P35052 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC1P35052 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPC1P35052 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPC1P35052 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC1P35052 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC1P35052 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC1P35052 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC1P35052 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC1P35052 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC1P35052 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC1P35052 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC1P35052 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC1P35052 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC1P35052 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC1P35052 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC1P35052 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC1P35052 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms