Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GPC1P35052 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GPC1P35052 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GPC1P35052 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GPC1P35052 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GPC1P35052 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GPC1P35052 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GPC1P35052 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GPC1P35052 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GPC1P35052 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GPC1P35052 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GPC1P35052 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPC1P35052 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GPC1P35052 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC1P35052 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPC1P35052 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPC1P35052 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPC1P35052 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPC1P35052 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPC1P35052 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPC1P35052 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPC1P35052 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC1P35052 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC1P35052 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC1P35052 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC1P35052 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPC1P35052 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC1P35052 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC1P35052 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPC1P35052 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPC1P35052 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPC1P35052 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPC1P35052 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPC1P35052 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPC1P35052 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPC1P35052 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC1P35052 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPC1P35052 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPC1P35052 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPC1P35052 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPC1P35052 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC1P35052 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC1P35052 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC1P35052 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC1P35052 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC1P35052 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC1P35052 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC1P35052 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC1P35052 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC1P35052 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC1P35052 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC1P35052 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC1P35052 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC1P35052 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC1P35052 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC1P35052 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC1P35052 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC1P35052 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPC1P35052 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC1P35052 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC1P35052 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC1P35052 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPC1P35052 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC1P35052 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC1P35052 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC1P35052 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC1P35052 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC1P35052 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC1P35052 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC1P35052 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPC1P35052 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC1P35052 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC1P35052 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC1P35052 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC1P35052 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPC1P35052 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPC1P35052 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GPC1P35052 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC1P35052 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC1P35052 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPC1P35052 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC1P35052 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC1P35052 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC1P35052 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC1P35052 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC1P35052 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC1P35052 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC1P35052 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC1P35052 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC1P35052 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPC1P35052 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC1P35052 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPC1P35052 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC1P35052 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPC1P35052 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPC1P35052 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPC1P35052 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC1P35052 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC1P35052 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC1P35052 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms