Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CD40LGP29965 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD40LGP29965 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD40LGP29965 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD40LGP29965 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD40LGP29965 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD40LGP29965 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD40LGP29965 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD40LGP29965 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD40LGP29965 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD40LGP29965 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD40LGP29965 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD40LGP29965 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD40LGP29965 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms