Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMA4P25789 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMA4P25789 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMA4P25789 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA4P25789 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA4P25789 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA4P25789 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA4P25789 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMA4P25789 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMA4P25789 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMA4P25789 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMA4P25789 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.2 ms