Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPP1P10451 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPP1P10451 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPP1P10451 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPP1P10451 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPP1P10451 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPP1P10451 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPP1P10451 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPP1P10451 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPP1P10451 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPP1P10451 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPP1P10451 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPP1P10451 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPP1P10451 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPP1P10451 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPP1P10451 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPP1P10451 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPP1P10451 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPP1P10451 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPP1P10451 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPP1P10451 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPP1P10451 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPP1P10451 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPP1P10451 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPP1P10451 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPP1P10451 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPP1P10451 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPP1P10451 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPP1P10451 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPP1P10451 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPP1P10451 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPP1P10451 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPP1P10451 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPP1P10451 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPP1P10451 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPP1P10451 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPP1P10451 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPP1P10451 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPP1P10451 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPP1P10451 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPP1P10451 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPP1P10451 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPP1P10451 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPP1P10451 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPP1P10451 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPP1P10451 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPP1P10451 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPP1P10451 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPP1P10451 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPP1P10451 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPP1P10451 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPP1P10451 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPP1P10451 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPP1P10451 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPP1P10451 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPP1P10451 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPP1P10451 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPP1P10451 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPP1P10451 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPP1P10451 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPP1P10451 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPP1P10451 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPP1P10451 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPP1P10451 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPP1P10451 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPP1P10451 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPP1P10451 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPP1P10451 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPP1P10451 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPP1P10451 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPP1P10451 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPP1P10451 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPP1P10451 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPP1P10451 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPP1P10451 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPP1P10451 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPP1P10451 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPP1P10451 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPP1P10451 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPP1P10451 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPP1P10451 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPP1P10451 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPP1P10451 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPP1P10451 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPP1P10451 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPP1P10451 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPP1P10451 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPP1P10451 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPP1P10451 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPP1P10451 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPP1P10451 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPP1P10451 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPP1P10451 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPP1P10451 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPP1P10451 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPP1P10451 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPP1P10451 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPP1P10451 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPP1P10451 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPP1P10451 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms