Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB40ALP0C0E4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB40ALP0C0E4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB40ALP0C0E4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB40ALP0C0E4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB40ALP0C0E4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms