Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RAB40ALP0C0E4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RAB40ALP0C0E4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAB40ALP0C0E4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RAB40ALP0C0E4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAB40ALP0C0E4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAB40ALP0C0E4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAB40ALP0C0E4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
RAB40ALP0C0E4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RAB40ALP0C0E4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RAB40ALP0C0E4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAB40ALP0C0E4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAB40ALP0C0E4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAB40ALP0C0E4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAB40ALP0C0E4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RAB40ALP0C0E4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAB40ALP0C0E4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB40ALP0C0E4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAB40ALP0C0E4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAB40ALP0C0E4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAB40ALP0C0E4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAB40ALP0C0E4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAB40ALP0C0E4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAB40ALP0C0E4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAB40ALP0C0E4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAB40ALP0C0E4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB40ALP0C0E4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB40ALP0C0E4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB40ALP0C0E4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB40ALP0C0E4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB40ALP0C0E4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB40ALP0C0E4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB40ALP0C0E4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAB40ALP0C0E4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RAB40ALP0C0E4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAB40ALP0C0E4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB40ALP0C0E4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB40ALP0C0E4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB40ALP0C0E4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB40ALP0C0E4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB40ALP0C0E4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB40ALP0C0E4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB40ALP0C0E4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB40ALP0C0E4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB40ALP0C0E4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB40ALP0C0E4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB40ALP0C0E4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB40ALP0C0E4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB40ALP0C0E4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB40ALP0C0E4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB40ALP0C0E4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAB40ALP0C0E4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB40ALP0C0E4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB40ALP0C0E4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB40ALP0C0E4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB40ALP0C0E4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB40ALP0C0E4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB40ALP0C0E4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB40ALP0C0E4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB40ALP0C0E4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB40ALP0C0E4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB40ALP0C0E4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB40ALP0C0E4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB40ALP0C0E4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB40ALP0C0E4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB40ALP0C0E4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB40ALP0C0E4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB40ALP0C0E4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB40ALP0C0E4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB40ALP0C0E4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB40ALP0C0E4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB40ALP0C0E4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB40ALP0C0E4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB40ALP0C0E4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB40ALP0C0E4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB40ALP0C0E4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB40ALP0C0E4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB40ALP0C0E4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB40ALP0C0E4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB40ALP0C0E4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB40ALP0C0E4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB40ALP0C0E4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB40ALP0C0E4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB40ALP0C0E4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB40ALP0C0E4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB40ALP0C0E4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB40ALP0C0E4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB40ALP0C0E4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB40ALP0C0E4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB40ALP0C0E4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB40ALP0C0E4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB40ALP0C0E4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB40ALP0C0E4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB40ALP0C0E4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB40ALP0C0E4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB40ALP0C0E4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB40ALP0C0E4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB40ALP0C0E4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB40ALP0C0E4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB40ALP0C0E4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms