Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEDO75530 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEDO75530 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEDO75530 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
EEDO75530 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEDO75530 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEDO75530 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEDO75530 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEDO75530 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEDO75530 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEDO75530 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EEDO75530 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEDO75530 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEDO75530 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEDO75530 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEDO75530 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEDO75530 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EEDO75530 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEDO75530 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEDO75530 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEDO75530 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EEDO75530 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEDO75530 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEDO75530 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEDO75530 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEDO75530 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEDO75530 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEDO75530 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEDO75530 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEDO75530 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEDO75530 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEDO75530 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EEDO75530 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EEDO75530 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EEDO75530 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EEDO75530 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EEDO75530 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEDO75530 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEDO75530 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEDO75530 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEDO75530 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EEDO75530 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEDO75530 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EEDO75530 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEDO75530 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEDO75530 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEDO75530 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EEDO75530 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
EEDO75530 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EEDO75530 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EEDO75530 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EEDO75530 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EEDO75530 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EEDO75530 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EEDO75530 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EEDO75530 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EEDO75530 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EEDO75530 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEDO75530 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEDO75530 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEDO75530 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EEDO75530 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEDO75530 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEDO75530 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEDO75530 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEDO75530 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEDO75530 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEDO75530 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEDO75530 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EEDO75530 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEDO75530 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEDO75530 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEDO75530 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEDO75530 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEDO75530 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEDO75530 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEDO75530 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EEDO75530 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEDO75530 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEDO75530 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEDO75530 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEDO75530 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEDO75530 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEDO75530 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEDO75530 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEDO75530 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEDO75530 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEDO75530 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEDO75530 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEDO75530 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEDO75530 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEDO75530 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEDO75530 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEDO75530 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEDO75530 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEDO75530 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EEDO75530 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEDO75530 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEDO75530 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEDO75530 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms