Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN2BO60939 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN2BO60939 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN2BO60939 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN2BO60939 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN2BO60939 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN2BO60939 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN2BO60939 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN2BO60939 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN2BO60939 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN2BO60939 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN2BO60939 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN2BO60939 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN2BO60939 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN2BO60939 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN2BO60939 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN2BO60939 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN2BO60939 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN2BO60939 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN2BO60939 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms