Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASA4O43374 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASA4O43374 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASA4O43374 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASA4O43374 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASA4O43374 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASA4O43374 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASA4O43374 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASA4O43374 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASA4O43374 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASA4O43374 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASA4O43374 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASA4O43374 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASA4O43374 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASA4O43374 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASA4O43374 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASA4O43374 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASA4O43374 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASA4O43374 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASA4O43374 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RASA4O43374 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASA4O43374 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASA4O43374 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RASA4O43374 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RASA4O43374 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RASA4O43374 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RASA4O43374 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RASA4O43374 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RASA4O43374 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RASA4O43374 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASA4O43374 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASA4O43374 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASA4O43374 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASA4O43374 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RASA4O43374 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RASA4O43374 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RASA4O43374 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASA4O43374 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASA4O43374 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASA4O43374 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASA4O43374 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASA4O43374 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASA4O43374 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASA4O43374 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RASA4O43374 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RASA4O43374 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASA4O43374 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RASA4O43374 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASA4O43374 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASA4O43374 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASA4O43374 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASA4O43374 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASA4O43374 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASA4O43374 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASA4O43374 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASA4O43374 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASA4O43374 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASA4O43374 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASA4O43374 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASA4O43374 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASA4O43374 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASA4O43374 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RASA4O43374 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RASA4O43374 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASA4O43374 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RASA4O43374 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASA4O43374 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASA4O43374 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASA4O43374 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASA4O43374 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASA4O43374 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASA4O43374 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASA4O43374 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASA4O43374 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASA4O43374 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASA4O43374 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASA4O43374 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASA4O43374 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASA4O43374 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASA4O43374 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASA4O43374 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASA4O43374 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASA4O43374 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASA4O43374 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASA4O43374 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASA4O43374 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASA4O43374 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASA4O43374 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASA4O43374 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASA4O43374 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASA4O43374 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASA4O43374 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASA4O43374 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASA4O43374 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASA4O43374 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASA4O43374 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASA4O43374 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASA4O43374 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASA4O43374 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASA4O43374 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms