Protein–RNA interactions for Protein: O43301

HSPA12A, Heat shock 70 kDa protein 12A, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA12AO43301 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSPA12AO43301 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA12AO43301 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPA12AO43301 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA12AO43301 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSPA12AO43301 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms