Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMD3O43242 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD3O43242 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD3O43242 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD3O43242 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMD3O43242 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD3O43242 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms