Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN25C9JDP6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN25C9JDP6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN25C9JDP6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN25C9JDP6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN25C9JDP6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms