Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACD1B0YJ81 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACD1B0YJ81 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACD1B0YJ81 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HACD1B0YJ81 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACD1B0YJ81 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACD1B0YJ81 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HACD1B0YJ81 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HACD1B0YJ81 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HACD1B0YJ81 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HACD1B0YJ81 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms