Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HACD1B0YJ81 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HACD1B0YJ81 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
HACD1B0YJ81 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HACD1B0YJ81 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HACD1B0YJ81 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HACD1B0YJ81 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HACD1B0YJ81 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HACD1B0YJ81 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HACD1B0YJ81 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HACD1B0YJ81 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HACD1B0YJ81 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HACD1B0YJ81 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HACD1B0YJ81 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HACD1B0YJ81 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HACD1B0YJ81 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HACD1B0YJ81 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HACD1B0YJ81 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HACD1B0YJ81 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HACD1B0YJ81 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HACD1B0YJ81 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HACD1B0YJ81 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HACD1B0YJ81 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HACD1B0YJ81 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HACD1B0YJ81 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
HACD1B0YJ81 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HACD1B0YJ81 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HACD1B0YJ81 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HACD1B0YJ81 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HACD1B0YJ81 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HACD1B0YJ81 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HACD1B0YJ81 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HACD1B0YJ81 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HACD1B0YJ81 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HACD1B0YJ81 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACD1B0YJ81 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HACD1B0YJ81 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HACD1B0YJ81 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HACD1B0YJ81 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HACD1B0YJ81 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HACD1B0YJ81 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACD1B0YJ81 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HACD1B0YJ81 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HACD1B0YJ81 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HACD1B0YJ81 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HACD1B0YJ81 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HACD1B0YJ81 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HACD1B0YJ81 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HACD1B0YJ81 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HACD1B0YJ81 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HACD1B0YJ81 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HACD1B0YJ81 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HACD1B0YJ81 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HACD1B0YJ81 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HACD1B0YJ81 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HACD1B0YJ81 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HACD1B0YJ81 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HACD1B0YJ81 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HACD1B0YJ81 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HACD1B0YJ81 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HACD1B0YJ81 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HACD1B0YJ81 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HACD1B0YJ81 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HACD1B0YJ81 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HACD1B0YJ81 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HACD1B0YJ81 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HACD1B0YJ81 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HACD1B0YJ81 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HACD1B0YJ81 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HACD1B0YJ81 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HACD1B0YJ81 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HACD1B0YJ81 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HACD1B0YJ81 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HACD1B0YJ81 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HACD1B0YJ81 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HACD1B0YJ81 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HACD1B0YJ81 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HACD1B0YJ81 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HACD1B0YJ81 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HACD1B0YJ81 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HACD1B0YJ81 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HACD1B0YJ81 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HACD1B0YJ81 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HACD1B0YJ81 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HACD1B0YJ81 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HACD1B0YJ81 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HACD1B0YJ81 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HACD1B0YJ81 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HACD1B0YJ81 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HACD1B0YJ81 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HACD1B0YJ81 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HACD1B0YJ81 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HACD1B0YJ81 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HACD1B0YJ81 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HACD1B0YJ81 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HACD1B0YJ81 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HACD1B0YJ81 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HACD1B0YJ81 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HACD1B0YJ81 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HACD1B0YJ81 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms