Protein–RNA interactions for Protein: A2A288

ZC3H12D, Probable ribonuclease ZC3H12D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12DA2A288 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12DA2A288 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12DA2A288 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZC3H12DA2A288 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12DA2A288 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZC3H12DA2A288 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZC3H12DA2A288 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms