Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1Z2

IGKV1D-43, Immunoglobulin kappa variable 1D-43, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms