Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARFGEF2Q9Y6D5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARFGEF2Q9Y6D5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARFGEF2Q9Y6D5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARFGEF2Q9Y6D5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ARFGEF2Q9Y6D5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARFGEF2Q9Y6D5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARFGEF2Q9Y6D5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARFGEF2Q9Y6D5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARFGEF2Q9Y6D5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ARFGEF2Q9Y6D5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARFGEF2Q9Y6D5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARFGEF2Q9Y6D5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARFGEF2Q9Y6D5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARFGEF2Q9Y6D5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ARFGEF2Q9Y6D5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ARFGEF2Q9Y6D5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARFGEF2Q9Y6D5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARFGEF2Q9Y6D5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ARFGEF2Q9Y6D5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARFGEF2Q9Y6D5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARFGEF2Q9Y6D5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
ARFGEF2Q9Y6D5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARFGEF2Q9Y6D5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARFGEF2Q9Y6D5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARFGEF2Q9Y6D5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARFGEF2Q9Y6D5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARFGEF2Q9Y6D5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARFGEF2Q9Y6D5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARFGEF2Q9Y6D5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARFGEF2Q9Y6D5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARFGEF2Q9Y6D5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARFGEF2Q9Y6D5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARFGEF2Q9Y6D5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARFGEF2Q9Y6D5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARFGEF2Q9Y6D5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARFGEF2Q9Y6D5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms